Instalei o Debian recentemente numa máquina antiga e para fazer o mouse serial funcionar, foi necessário editar o arquivo /etc/X11/xorg.conf, logado como root ou com o comando sudo.
Faça uma copia de segurança do arquivo, se algo errado acontecer, restaure o arquivo original.
Altere a seção de configuração do mouse, para que fique aproximadamente assim:
Section “InputDevice”
Identifier “Configured Mouse”
Driver “mouse”
Option “CorePointer”
Option “Device” “/dev/ttyS0″
Option “Protocol” “Microsoft”
Option “Emulate3Buttons” “true”
Option “ZAxisMapping” “4 5″
EndSection
(Se você tem um mouse com roda, ao invés de “Microsoft”, use “IntelliMouse” na Option “Protocol”)
/dev/ttyS0 é a porta serial onde seu mouse está conectado. Normalmente o mouse será conectado à primeira porta (por isso o ’0′ no final), se o mouse estiver em outra porta, mude o ’0′ por ’1′ ou ’2′, de acordo com seu sistema.
Testado no Debian Lenny.